E με την λογική πως το Steam κάνει δικά του folders, αλλού και γενικά άλλη εγκατάσταση (και κάτι τέτοιo νομίζω έλεγε στο FAQ).

Φαντάζομαι με clean install από site amd δε θα έχεις κανένα πρόβλημα.